Il devait quitter ses fonctions de président de PAI Partners en 2016. Finalement, Lionel Zinsou part plutôt que prévu pour devenir premier ministre du Bénin.
Jusque-là conseiller du président Yayi Boni, poste qu’il cumulait avec ses fonctions de président du plus grand fonds d’investissement français, Lionel Zinsou fait partie avec quelques économistes franco-africains des concepteurs de la Fondation franco-africaine pour la croissance dont il est le dirigeant.
Le retour au pays natal pour le franco-béninois correspond à un moment particulier, le président Boni Yayi ayant annoncé publiquement qu’il ne tripatouillerait pas la constitution pour un troisiéme mandat. Sitôt annoncé le 18 juin, monsieur Zinsou a formé son gouvernement qui comprend un poste inédit de vice premier ministre occupé par François Abiola.